18 may 1992-ci ildə Azərbaycanla Moldova arasında diplomatik münasibətlər qurulmuşdur
Vaxtilə SSRİ-nin tərkibində olan Azərbaycan və Moldova respublikaları arasında hər zaman dostluq münasibətləri olmuş, müstəqilliklərini əldə etdikdən sonra ölkələr arasında əməkdaşlıq əlaqələrinin genişləndirilməsi istiqamətində mühüm addımlar atılmışdır. 1992-ci il may ayının 18-də Azərbaycan-Moldova diplomatik münasibətləri qurulmuşdur. 1997-ci il noyabrın 26-28-də Moldova Prezidenti Petru Luçinskinin Azərbaycana ilk rəsmi səfəri ölkələr arasında əlaqələrin möhkəmlənməsində, ümumiyyətlə, Azərbaycan-Moldova münasibətlərində mühüm mərhələ təşkil etmişdir. 2005-ci il oktyabrın 5-də Azərbaycanın Moldovada, həmin ilin noyabrında isə Moldovanın ölkəmizdə səfirliyi açılmışdır.
Hələ ötən əsrin 90-cı illərinin sonlarında əlaqələrin inkişafı istiqamətində irəliləyişlər əldə olunmuş, Azərbaycan Respublikası və Moldova Respublikası arasında dostluq və əməkdaşlıq haqqında Müqavilə, Azərbaycan Respublikası Hökuməti ilə Moldova Respublikası Hökuməti arasında ikiqat vergiyə cəlb etməyə yol verilməməsi, gəlir və əmlak vergilərinin ödənilməsindən yayınmanın qarşısının alınması haqqında Konvensiya, vergi qanunvericiliyinə əməl edilməsi məsələləri üzrə qarşılıqlı yardım və əməkdaşlıq, elmi-texniki əməkdaşlıq, investisiyaların təşviqi və qarşılıqlı qorunması və.s sənədlər imzalanmışdır. Ölkələr arasında təhsil, mədəniyyət, səhiyyə, valyuta və ixrac nəzarəti sahəsində əməkdaşlıq və qarşılıqlı yardım haqqında sazişlər, Azərbaycan Respublikası Xarici İşlər Nazirliyi və Moldova Respublikası Xarici İşlər Nazirliyi arasında əməkdaşlıq haqqında Protokol da imzalanan sənədlər sırasında yer almışdır.
2004-cü ildə Moldova Prezidenti Vladimir Voronin Azərbaycanda rəsmi səfərdə olmuş, Prezident İlham Əliyevlə təkbətək görüşmüşdür. Görüş zamanı hər iki dövlət başçısı ölkələrinin işğala məruz qaldıqları, buna son qoyulması üçün səylərin birləşdirilməsinin vacibliyini qeyd etmişlər. Səfər çərçivəsində qarşılıqlı faydalı münasibətləri tənzimləyən bir sıra sənədlər - Azərbaycan Respublikası Prezidentinin və Moldova Respublikası Prezidentinin Birgə Bəyannaməsi, Azərbaycan Respublikası və Moldova Respublikası arasında mülki, ailə və cinayət işləri üzrə hüquqi yardım və hüquqi münasibətlər haqqında Müqavilə, Azərbaycan Respublikasının Hökuməti ilə Moldova Respublikasının Hökuməti arasında uzunmüddətli iqtisadi əməkdaşlıq, Azərbaycan Respublikasının Ədliyyə Nazirliyi və Moldova Respublikasının Ədliyyə Nazirliyi arasında, əmək və əhalinin sosial müdafiəsi sahəsində, Azərbaycan Respublikası Kənd Təsərrüatı Nazirliyi ilə Moldova Respublikası Kənd Təsərrüfatı və Yeyinti Nazirliyi arasında iqtisadi və elmi-texniki əməkdaşlıq haqqında sazişlər, Azərbaycan Respublikasının Xarici İşlər Nazirliyi ilə Moldova Respublikasının Xarici İşlər Nazirliyi arasında 2005-2006-cı illər üçün məsləhətləşmələr Planı və s. imzalanmışdır.
2005-ci ildə Azərbaycan Prezidenti İlham Əliyevin Moldovaya rəsmi səfəri beynəlxalq və regional məsələlərin müzakirəsi baxımından mühüm əhəmiyyət kəsb etmişdir. Moldovanın Prezidenti Vladimir Voroninlə təkbətək görüş zamanı dövlət başçıları suveren dövlətlərin ərazinin bütövlüyünə qarşı yönəlmiş təcavüz aktlarının yolverilməzliyini diqqətə çatdırmışlar. Görüşün nəticəsi olaraq imzalanan sənədlər arasında hava əlaqəsi, informasiya texnologiyaları sahəsində əməkdaşlıq, "Azərbaycan Televiziya və Radio Verilişləri" Qapalı Səhmdar Cəmiyyəti və "Teleradio-Moldova" İctimai Şirkəti arasında əməkdaşlıq haqqında sazişlər mühüm sənədlər kimi dəyərləndirilmişdir.
Azərbaycanın ərazi bütövlüyünü dəstəkləyən Moldova Respublikası Ermənistan-Azərbaycan münaqişəsinin həllinə təkan verə biləcək tədbirlərdə fəal şəkildə iştirak etməyə hər zaman hazır olduğunu bəyan etmişdir. Belə ki, 2008-ci ildə BMT Baş Məclisinin 62-ci sessiyasında Azərbaycan-Ermənistan münaqişəsi ilə bağlı qurumun qəbul etdiyi qətnamənin müzakirəsi zamanı Moldova ölkəmizin lehinə səs vermişdir. Öz növbəsində, Azərbaycan da hər zaman Moldovanın ərazi bütövlüyünün bərpasını, Dnestryanı bölgə probleminin nizama salınması sahəsində fəaliyyətini qətiyyətlə dəstəkləmişdir.
Dövlət başçılarının qarşılıqlı səfərləri, müxtəlif beynəlxalq təşkilatlarda görüşlər ikitərəfli əlaqələri daha da dərinləşdirir. Bu gün Azərbaycan ilə Moldova arasında iqtisadi əlaqələr özünün inkişaf mərhələsinə yüksəlib. Moldova həm ikitərəfli, həm də Demokratiya və İqtisadi İnkişaf Uğrunda Təşkilat (GUAM) kimi təşkilatlar çərçivəsində Azərbaycanla əlaqələri genişləndirir.
